Test de microbiota intestinal: qué es, qué tipos existen y cuál necesitas si tienes síntomas digestivos

Pero ¡atención! Saber que tienes disbiosis ¡no es suficiente! Lo importante es saber qué tipo de disbiosis tienes, qué microorganismos están sobrecrecidos, cuáles faltan, si hay algún patógeno presente que no se había detectado todavía y sobre todo conocer la causa real que creó ese desequilibrio (Spoiler: en consulta te ayudo con todo y juntas resolveremos la situación).

¿Qué tipos de test de microbiota intestinal hay?

Aquí es donde mucha gente se pierde, y es completamente normal, porque no existe un solo "test de microbiota". Hay varios métodos y sus diferencias son enormes. No es lo mismo hacerse uno que otro.

EL CULTIVO MICROBIOLÓGICO

El cultivo microbiológico es lo que generalmente el médico pide cuando sospecha de infección. Se toma una muestra de heces, en el laboratorio se pone a crecer esa muestra en un medio de cultivo y se espera a ver qué bacterias aparecen.

Es rápido, barato (por eso lo que cubre las mútuas/Seguridad social) y útil para detectar ciertos patógenos concretos en procesos agudos.

El problema es que entre el 60 y el 70% de la microbiota intestinal no puede crecer en cultivo. Porque son bacterias anaerobias estrictas que mueren al contacto con el oxígeno, o microorganismos que necesitan condiciones tan específicas que es imposible reproducirlas en un laboratorio convencional.

EL TEST DE ALIENTO (el que hacen para detectar el famoso SIBO)

Lo incluyo aquí por si piensas en él como una solución pero no es propiamente un test de microbiota digestiva.

El test de aliento detecta si hay sobrecrecimiento, pero no te dice qué microorganismo lo está causando, ni en qué cantidad, ni si hay resistencias a antibióticos. Tampoco evalúa la microbiota del colon ni detecta infecciones por parásitos u hongos. Para tener esa información completa, hace falta un análisis de microbiota más profundo.

SECUENCIACIÓN DEL GEN 16S

Todas las bacterias tienen un gen llamado 16S rRNA. Para este test se recoge una muestra de heces, se extrae el ADN de la muestra, se amplifica ese gen y se secuencia. El resultado se compara con bases de datos enormes de microorganismos conocidos y se genera un perfil de qué bacterias hay y en qué proporción.

Con este método se puede ver la mayoría de la comunidad bacteriana, detectar patrones de disbiosis y hacer comparaciones con poblaciones de referencia.

Es una herramienta mucho más potente que el cultivo, pero tiene limitaciones importantes:

• Normalmente llega hasta el nivel de género, no de especie (por ejemplo nos dirá si tienes presencia de E. coli, pero no nos dirá si es una cepa de E.coli inofensiva o una patógena).
• Solo detecta bacterias. Los hongos, virus y parásitos no aparecen porque el gen 16S no existe en ellos.
• No da información sobre la función de los microorganismos.
• Puede infrarrepresentar las bacterias presentes en poca cantidad, que a veces son las más relevantes clínicamente.

TEST DE METAGENÓMICA

También llamado shotgun o WMS. Es el nivel premium de los tests. En lugar de buscar solo un gen concreto, la metagenómica lee todo el ADN de la muestra. Con este test podemos identificar las bacterias, hongos, virus, parásitos, arqueas y plásmidos que tienes en el intestino. El resultado por tanto será una imagen completa y detallada de qué microorganismos hay y de qué están haciendo.

Además:

• Dará datos a nivel de especie y de cepa (así podremos diferenciar si la E. coli que tienes es la versión inofensiva o una cepa enteropatógena que está causando problemas)
• Detectará todos los parásitos intestinales: Giardia, Blastocystis, Cryptosporidium, Entamoeba... que muchas veces pasan desapercibidos en el resto de métodos.
• Aportará información funcional: qué genes metabólicos están activos, si tus bacterias están produciendo ácidos grasos de cadena corta que protegen tu intestino, si hay productores excesivos de sulfuro de hidrógeno que inflama la mucosa o metano, etc.
• Nos informará de posibles resistencias a antibióticos en el ecosistema intestinal: el llamado resistoma.
• Detallará el número de especies que tienes. Nos dirá ¡cuánta diversidad hay! dato importantísimo para poner luego el tratamiento.

Tengo la microbiota intestinal alterada: ¿qué test de microbiota intestinal necesito según mis síntomas?

Esta es la pregunta que más me hacen. Y la respuesta es depende. En consulta no siempre pido el mismo tipo de test ni a todos los pacientes les pido uno.  Por tanto, el primer consejo y creo que el más importante sería NO PIDAS DIRECTAMENTE UN TEST EN UN LABORATORIO.  ¿Por qué? Pues porque tienes muchas posibilidades de que no sea el necesario y que desembolses un dinero que no merece la pena gastar. Además, lo más importante es la interpretación del mismo dentro de tu contexto clínico.

Los test, igual que las analíticas, no tienen sentido sin un contexto clínico, sin un historial y sin una anamnesis (la entrevista inicial) correctamente realizada.

Para explicártelo de un modo más sencillo, si a mí me envías un test por email y me pides que te lo analice, no lo voy a hacer porque me faltará la información más importante y clave para resolver tu caso. Necesito primero hacer una entrevista contigo, saber todo de ti y de tu pasado y luego valorar si necesitamos un test, o una analítica o nada de eso es imprescindible. Si quieres saber cómo lo hago puedes leer luego este post.

Conclusión: no te resignes a no saber qué pasa en tu intestino

Me gustaría que te quedaran varias cosas claras:

• Tener síntomas digestivos crónicos sin explicación, no significa que no la haya. Solo quiere decir que todavía no se ha encontrado, quizás por no utilizar las herramientas adecuadas o bien por desconocimiento del profesional.
• Un test sin contexto clínico es papel mojado.
• A veces con el test acortamos el camino y vamos más seguras, pero es algo que valoraremos en consulta.
• No siempre necesitaremos que te gastes dinero en un test. Muchas veces con la información que extraigo en consulta tengo suficiente para trabajar con éxito.

Durante muchos años, el diagnóstico de "colon irritable" o "intestino irritable" fue básicamente la manera de decir "no sabemos qué tienes". Hoy eso está cambiando, si sabes encontrar el profesional adecuado y utilizas las herramientas adecuadas. Un test mal elegido, mal interpretado o sin seguimiento profesional no te va a dar las respuestas que buscas. La clave es saber qué test se ajusta a tu caso, contar con alguien que sepa interpretar los resultados en el contexto de tu historia clínica y que te acompañe en tu proceso terapéutico.

Recuerda los síntomas remiten cuando se trabaja la causa real. Te espero en consulta.

Un abrazo,

Anna Martínez

• Psiconeuroinmunologia clínica PNI
• Dietética Integrativa - colegiada nº2236
• Coaching

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